Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SftpdP50404 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SftpdP50404 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SftpdP50404 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms