Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc13P50207 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms