Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SrprbP47758 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SrprbP47758 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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