Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rpl28P41105 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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