Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VhlP40338 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
VhlP40338 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VhlP40338 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VhlP40338 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VhlP40338 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
VhlP40338 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VhlP40338 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VhlP40338 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VhlP40338 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VhlP40338 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VhlP40338 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VhlP40338 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VhlP40338 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VhlP40338 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VhlP40338 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
VhlP40338 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
VhlP40338 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VhlP40338 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VhlP40338 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VhlP40338 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VhlP40338 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VhlP40338 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VhlP40338 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms