Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ThpoP40226 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ThpoP40226 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms