Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk4P30285 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk4P30285 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms