Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RxraP28700 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RxraP28700 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
RxraP28700 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RxraP28700 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RxraP28700 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RxraP28700 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RxraP28700 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RxraP28700 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RxraP28700 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RxraP28700 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RxraP28700 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RxraP28700 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RxraP28700 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RxraP28700 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RxraP28700 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RxraP28700 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RxraP28700 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RxraP28700 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RxraP28700 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RxraP28700 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RxraP28700 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RxraP28700 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RxraP28700 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RxraP28700 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RxraP28700 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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RxraP28700 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RxraP28700 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RxraP28700 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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