Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BgnP28653 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BgnP28653 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BgnP28653 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BgnP28653 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BgnP28653 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BgnP28653 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BgnP28653 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BgnP28653 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
BgnP28653 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BgnP28653 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BgnP28653 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BgnP28653 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BgnP28653 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BgnP28653 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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