Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PparaP23204 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PparaP23204 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PparaP23204 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PparaP23204 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PparaP23204 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms