Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcb4P21440 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcb4P21440 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcb4P21440 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcb4P21440 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcb4P21440 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcb4P21440 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcb4P21440 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcb4P21440 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcb4P21440 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcb4P21440 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcb4P21440 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcb4P21440 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb4P21440 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb4P21440 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb4P21440 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb4P21440 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcb4P21440 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms