Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms