Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms