Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P10404 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P10404 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms