Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PolP10400 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PolP10400 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PolP10400 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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