Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Spta1P08032 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Spta1P08032 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Spta1P08032 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Spta1P08032 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Spta1P08032 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Spta1P08032 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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