Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01660 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01660 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01660 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01660 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01660 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01660 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01660 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01660 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01660 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01660 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01660 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01660 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01660 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01660 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01660 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01660 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01660 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01660 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01660 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01660 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01660 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01660 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01660 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01660 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms