Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BlmO88700 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BlmO88700 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BlmO88700 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BlmO88700 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BlmO88700 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BlmO88700 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BlmO88700 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BlmO88700 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BlmO88700 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BlmO88700 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BlmO88700 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BlmO88700 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
BlmO88700 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
BlmO88700 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
BlmO88700 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BlmO88700 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BlmO88700 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BlmO88700 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BlmO88700 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BlmO88700 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BlmO88700 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BlmO88700 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BlmO88700 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BlmO88700 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BlmO88700 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BlmO88700 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BlmO88700 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BlmO88700 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BlmO88700 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BlmO88700 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BlmO88700 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BlmO88700 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BlmO88700 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BlmO88700 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BlmO88700 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BlmO88700 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BlmO88700 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BlmO88700 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BlmO88700 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BlmO88700 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BlmO88700 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BlmO88700 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BlmO88700 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BlmO88700 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BlmO88700 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BlmO88700 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BlmO88700 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BlmO88700 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BlmO88700 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BlmO88700 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BlmO88700 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BlmO88700 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BlmO88700 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BlmO88700 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BlmO88700 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BlmO88700 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BlmO88700 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BlmO88700 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BlmO88700 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms