Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cbx4O55187 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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