Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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FxnO35943 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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FxnO35943 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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FxnO35943 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FxnO35943 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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