Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ColqO35348 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ColqO35348 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ColqO35348 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms