Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc18a3O35304 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms