Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3239L7N2D9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.1 ms