Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms