Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5294J3QP53 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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