Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Smim18J3QNP2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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