Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm3415J3QMS8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Gm3415J3QMS8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3415J3QMS8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Gm3415J3QMS8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Gm3415J3QMS8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Gm3415J3QMS8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Gm3415J3QMS8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Gm3415J3QMS8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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