Protein–RNA interactions for Protein: G8JL69

Gm11027, Predicted gene 11027, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11027G8JL69 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm11027G8JL69 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms