Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms