Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34aG3UW52 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms