Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms