Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
6030445D17RikE9Q8F9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms