Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc8E9PWG2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms