Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc170D3YXL0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc170D3YXL0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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