Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Gm17333C6EQI3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Gm17333C6EQI3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Gm17333C6EQI3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Gm17333C6EQI3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Gm17333C6EQI3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Gm17333C6EQI3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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