Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc5C3VPR6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms