Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cspp1B2RX88 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms