Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AU015836B2RUM3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AU015836B2RUM3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms