Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms