Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem238A9JSM3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms