Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn3aA2ASI5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn3aA2ASI5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms