Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms