Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Prdm12A2AJ77 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prdm12A2AJ77 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prdm12A2AJ77 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prdm12A2AJ77 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Prdm12A2AJ77 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Prdm12A2AJ77 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Prdm12A2AJ77 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Prdm12A2AJ77 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Prdm12A2AJ77 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Prdm12A2AJ77 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Prdm12A2AJ77 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Prdm12A2AJ77 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Prdm12A2AJ77 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prdm12A2AJ77 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Prdm12A2AJ77 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm12A2AJ77 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm12A2AJ77 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm12A2AJ77 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm12A2AJ77 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm12A2AJ77 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm12A2AJ77 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm12A2AJ77 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm12A2AJ77 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm12A2AJ77 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm12A2AJ77 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm12A2AJ77 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm12A2AJ77 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm12A2AJ77 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm12A2AJ77 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm12A2AJ77 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm12A2AJ77 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm12A2AJ77 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm12A2AJ77 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm12A2AJ77 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prdm12A2AJ77 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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