Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rbbp8nlA2ABX0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp8nlA2ABX0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms