Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms