Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ilf3Q9Z1X4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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