Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Znf394Q9Z1D9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Znf394Q9Z1D9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Znf394Q9Z1D9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Znf394Q9Z1D9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Znf394Q9Z1D9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Znf394Q9Z1D9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Znf394Q9Z1D9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Znf394Q9Z1D9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf394Q9Z1D9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms