Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PapolbQ9WVP6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PapolbQ9WVP6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms