Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stxbp4Q9WV89 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms