Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms